Gambar Geber86 / Getty
Poin Penting
- Rumah Sakit Anak Los Angeles melakukan survei genomik COVID-19 anak terbesar hingga saat ini.
- Studi tersebut melaporkan kemungkinan adanya hubungan antara mutasi SARS-CoV-2 tertentu dan tingkat keparahan penyakit.
- Sampel menunjukkan variasi genetik tingkat tinggi di California.
Seperti banyak virus, SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19, mengalami banyak mutasi genetik saat menyebar ke populasi besar. Ilmuwan baru mulai memahami variasi ini dan dampaknya terhadap hasil kesehatan, terutama pada anak-anak.
Dalam studi genomik COVID-19 pediatrik terbesar hingga saat ini, tim dari Rumah Sakit Anak di Los Angeles menemukan hubungan antara mutasi virus dan tingkat keparahan penyakit. Studi November diterbitkan di jurnalBuka Forum Penyakit Menular.
“Jika kami dapat melakukan apa pun untuk mengetahui apakah ada korelasi antara genetika mutasi genom virus dan fenotipe penyakit (karakteristik COVID-19 yang dapat diamati), Anda dapat diberi tahu tentang cara terbaik untuk merawat pasien,” Xiaowu Gai , PhD, salah satu penulis studi dan direktur bioinformatika di Children's Hospital Los Angeles, mengatakan kepada Verywell.
Dalam upaya untuk lebih memahami bagaimana variasi genetik dapat mempengaruhi populasi anak, tim peneliti menganalisis informasi genetik virus dari 141 anak yang terinfeksi antara 13 Maret dan 16 Juni. Sampel ini menunjukkan tingkat variasi yang tinggi dan prevalensi yang umum. mutasi yang dikaitkan dengan tingkat penularan yang lebih tinggi.
Apa Artinya Ini Untuk Anda
Materi genetik SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19, terus berkembang. Para ilmuwan sedang bekerja untuk memahami bagaimana mutasi genetik dapat mempengaruhi penularan virus dan tingkat keparahan penyakit bagi pasien yang terinfeksi.
Virus yang Selalu Berubah
Mutasi adalah kesalahan yang terjadi dalam genom virus — atau materi genetik — saat bereplikasi. Kebanyakan virus mengalami beberapa variasi saat mereka mengedarkan suatu populasi. Dalam SARS-CoV-2, banyak mutasi yang tidak signifikan atau bahkan dapat melemahkan virus. Namun, yang lain mungkin memengaruhi seberapa mudah virus ditularkan dan bahkan seberapa parah penyakitnya.
“Ketika banyak orang memikirkan COVID-19, mereka memikirkan satu hal ini, singularitas ini," kata Gai. "Tapi bukan itu cara kami melihatnya. Virus dalam tubuh pasien mana pun dengan infeksi virus adalah campuran dari banyak salinan berbeda dari virus ini. "
Satu mutasi umum, yang disebut D614G, menyebabkan perubahan protein lonjakan virus. Meskipun tidak lazim ketika virus mulai menyebar ke seluruh dunia awal tahun ini, versinya telah menjadi dominan di seluruh dunia. Para penulis melaporkan bahwa itu ada di 99,3% dari sampel pediatrik yang mereka kumpulkan.
Mutasi D614G, yang meningkatkan protein lonjakan yang digunakan virus untuk masuk ke sel manusia, memungkinkan virus untuk menularkan dengan lebih mudah. Belum ada bukti konklusif bahwa mutasi ini mengubah tingkat keparahan gejala penyakit.
Protein lonjakan COVID-19 memediasi masuknya virus corona ke dalam sel inang.
Namun, tim peneliti menemukan hubungan antara clade 20C — versi virus yang bermutasi — dan gejala yang lebih parah. Clades 20A, 20B, dan 20C semuanya adalah versi virus yang baru-baru ini bermutasi. Semua kasus pediatrik yang parah dan semua kecuali satu kasus yang cukup parah dalam penelitian ini membawa versi virus dengan clade 20C.
Implikasi Mutasi
“Ketika publik melihat pernyataan seperti ini, kedengarannya menakutkan bahwa virus itu bermutasi,” kata Stuart Campbell Ray, MD, ahli penyakit menular dan profesor kedokteran di Universitas Johns Hopkins, kepada Verywell. “Tapi semua virus RNA memiliki tingkat mutasi. Dan tingkat mutasi SARS-CoV-2 sekitar lima kali lipat lebih lambat daripada influenza — setidaknya sampai saat ini. "
Tingkat mutasi yang relatif lambat ini dapat membantu para ilmuwan yang mencoba menangani virus baru. Namun, Ray memperingatkan bahwa dengan meningkatnya populasi orang yang terinfeksi, begitu pula kecepatan mutasi terjadi.
Dengan diperkenalkannya solusi untuk mendukung sistem kekebalan terhadap infeksi virus — seperti vaksinasi, paparan sebelumnya terhadap virus, plasma pemulihan, dan terapi antibodi — SARS-CoV-2 dapat berkembang untuk menghindari respons imun. Artinya, ada kemungkinan kandidat vaksin yang saat ini menjanjikan menjadi kurang efektif dalam beberapa bulan mendatang karena virus terus bermutasi.
“Ada risiko — karena pandemi ini di luar kendali — bahwa mutasi ini dapat terakumulasi dan mutasi yang benar dapat terjadi yang dapat menghindari respons imun,” kata Ray, yang tidak berafiliasi dengan penelitian ini.
Vaksin yang telah terbukti efektif kemungkinan besar masih akan melindungi tubuh dari virus. Tetapi, seperti halnya virus yang tersebar luas lainnya seperti influenza, tambahan atau versi baru dari vaksin mungkin diperlukan untuk menutupi semua jenis virus baru yang muncul di masa depan.
Berurusan Dengan Variabel Tidak Dikenal
Meskipun COVID-19 sering dilaporkan lebih ringan untuk anak-anak daripada orang dewasa, satu dari tiga anak yang dirawat di rumah sakit karena penyakit tersebut dirawat di ICU, menurut penelitian tersebut. Gai mengatakan bahwa untuk pasien yang mengalami perjalanan penyakit yang parah penyakit, memahami komposisi genetik virus dapat memberikan beberapa wawasan kunci untuk pengembangan pengobatan.
Namun, susunan virus itu sendiri hanya dapat memberi tahu para ahli genetika tentang bagaimana hal itu akan berdampak pada orang yang terinfeksi. Mereka juga harus mempertimbangkan demografi dan informasi genetik dari orang yang terinfeksi.
Gai memperingatkan bahwa sementara temuan ini mungkin mengisyaratkan korelasi antara mutasi tertentu dan hasil mereka, banyak penelitian yang lebih besar masih diperlukan untuk menunjukkan bahwa mutasi pasti menyebabkan penyakit yang lebih parah. Meskipun merupakan survei COVID-19 pediatrik genom terbesar hingga saat ini, survei itu hanya mencakup 141 anak.
“Itu sebenarnya bukan ukuran sampel yang sangat besar,” kata Gai. "Kami tidak mungkin melakukan analisis korelasi untuk setiap mutasi individu dengan fenotipe penyakit."
Selain itu, penelitian ini tidak memperhitungkan perbedaan usia, jenis kelamin, kondisi yang sudah ada sebelumnya, dan faktor penting lainnya. Temuan yang terkait dengan viral load pasien mungkin juga tidak tepat berdasarkan pada saat sampel diambil dari pasien. Namun, penelitian tersebut berkontribusi pada pengetahuan yang berkembang tentang bagaimana variasi genetik dapat membentuk hasil kesehatan yang penting.
“Kami membutuhkan laporan seperti ini untuk mengetahui bagaimana virus berkembang,” kata Ray. “Urutan dari studi seperti ini, jika digabungkan dengan urutan dari seluruh dunia, memiliki nilai yang besar dalam membantu kami memahami bagaimana virus ini berkembang dan apakah kami perlu menyesuaikan strategi kami untuk mengelolanya.”
